包皮龟头炎——最常见的并发症
包皮过长时，包皮内板与龟头之间形成一个温暖潮湿的腔隙，包皮垢（由脱落的上皮细胞和分泌物组成）容易在此积聚。这些物质成为细菌和真菌繁殖的理想培养基，极易引发包皮龟头炎。患者表现为包皮和龟头红肿、瘙痒、疼痛，翻开包皮可见大量白色或黄色包皮垢，伴有异味。反复发作的包皮龟头炎可使包皮口逐渐纤维化形成包茎，进一步加重病情。
真菌性包皮龟头炎尤其常见，白色念珠菌是最主要的致病菌。糖尿病患者的包皮龟头炎发生率更高，因为高血糖环境有利于真菌生长。治疗上需要局部抗真菌药物配合保持局部清洁干燥，但要从根本上解决问题，包皮环切术是较为有效的预防措施。
包皮嵌顿——需要紧急处理的急症
包皮过长者在性交或手淫时将包皮强行上翻后，如果包皮口较紧，可能无法自行复位，形成包皮嵌顿。嵌顿的包皮在龟头冠状沟处形成一个紧缩环，阻碍龟头血液循环和淋巴回流，导致龟头迅速肿胀、疼痛加剧、颜色变紫。如不及时复位，可在数小时内发展为龟头缺血坏死，后果极为严重。
尿道感染与上行性感染
包皮内的病原微生物可沿尿道逆行向上，引起尿道炎、膀胱炎，严重者可进一步上行感染至前列腺和附睾，导致前列腺炎和附睾炎。这些上行性感染的治疗难度较大，疗程较长，且容易反复发作。
对性功能与生育的影响
包皮过长者由于龟头长期被包皮包裹，敏感度异常增高，在性生活中容易出现早泄。反复的包皮龟头炎导致的疼痛不适也会影响性生活质量，使患者对性生活产生恐惧和回避心理。此外，包皮垢中的细菌可影响精液质量，对生育能力造成潜在影响。
阴茎癌风险——不可忽视的远期危害
流行病学调查显示，包皮过长和包茎与阴茎癌的发生密切相关。包皮垢的长期慢性刺激被认为是阴茎癌的重要诱因之一。在新生儿期即行包皮环切的犹太人群中，阴茎癌的发病率极低，这从反面证实了包皮过长与阴茎癌的关联。因此，对于存在包皮过长问题的男性，建议及早进行手术干预。